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核酸的提取
核酸包括dna、rna两种分子,在细胞中都是以与蛋白质结合的状态存在,核酸提取的主要步骤为:裂解细胞
去除与核酸结合的蛋白质以及多糖、脂类等生物大分子,去除其他不需要的核酸分子,如提取dna分子时,应去除rna,反之亦然。
沉淀核酸
纯化核酸,去除盐类,有机剂等杂质
(一)dna提取的经典方法
dna提取的经典方法,即所谓的酚-氯仿提取法。因为使用两种不同的有机溶剂交替抽提更容易将蛋白除去,提取次序为酚、酚/氯仿(1:1)、氯仿,这种方法提取的dna纯度高、片段大、效果好,缺点是较为繁琐。
说明:
回收上层水相时,一定不要接触两相的界面,以免将蛋白质等物质吸入新离心管。沉淀dna,无水乙醇是首选的有机溶剂。另:异丙醇、醋酸钠等。
70%乙醇漂洗dna,是为了去除残余的盐类,去除过量sds和酚等杂物,因为sds在70%的乙醇中保持溶解状态,不与dna共沉淀,从而通过弃上清液去除这种去污剂,避免对以后pcr反应的影响。te缓冲液:10mmol/ltris-hcl1mmol/ledtaph8.5或8
rna的提取
rna提取条件较dna要求严格,主要是因为临床标本及实验室环境中,存在大量对rna有强烈降解作用rnase。rnase是一类生物活性非常稳定的酶类。这种酶耐酸、耐碱、耐高温,如煮沸也不能使之完全失活。蛋白质变性剂可使之暂时失活,但变性剂去除后,又可恢复活性。除细胞内rnase以外,环境中灰尘、各种实验器皿和试剂、人体的汗液及唾液中均存在rnase,因此在提取rna时,关键要避免rnase对标本的污染及防止rnase对提取的rna的降解。
1.提取rna所用器皿的处理及溶液的准备
塑料制品。如试管、ep管、tip头,使用灭菌的一次性用品。
玻璃用品。如烧杯、试管和其他用品,常被rnase污染,使用前必须于180oc干燥8小时以上,或用0.1轕c水(焦碳酸二乙酯)浸泡处理。
depc是rnase的强抑制剂,作用机制是通过与蛋白质中的组氨酸结合,使蛋白质变性。37℃浸泡2小时,然后用灭菌水漂洗数次,于100℃干烤15分钟,去除器皿上残余depc。
所需溶液的配制。必须用高压灭菌的水和rna提取专用的化学试剂配制溶液,用干烤过的药匙称取试剂,把溶液装入无rnase的玻璃器皿。
严格来说,所有溶液均应用0.1轕c于37℃处理12小时以上,然后于100℃加热15分钟或高压灭菌15分钟,去除残余depc。
2.rna提取中rnase污染的控制
最主要的潜在污染源是操作人员的手,手直接触摸之处毫无疑问会留下rnase,另外,说话带出的唾液也富含rnase,故在涉及rna的一切操作过程中,都应戴一次性手套和口罩。实验中,如接触了“脏的”玻璃器皿和其他物品以后,手套就可能污染rnase,因此rna提取实验中,应勤换手套。rna提取方法
下面以异硫氰酸胍结合氯仿-酚提取法介绍rna的提取。
异硫氰酸胍是一种强用力的蛋白质变性剂,能迅速溶解蛋白质,导致细胞结构破碎,核蛋白由于其二级结构的破坏消失而迅速与核酸分离。
rnase虽可耐受多种处理,(如煮沸)而不失活,但却会被4mol/l异硫氰酸胍和-β巯基乙醇(破坏rnase蛋白质中的二硫键)等还原剂所灭活,因而可从组织中分离出完整rna分子。
因此上述试剂是制备rna的常规试剂。
200µl血清(浆)
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加入200µl20%peg6000
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4oc,3小时,12000rpm,4℃离心15分钟
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弃上清,加500µl裂解液(含异硫氰酸胍、-β巯基乙醇等),混匀
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