发现文章标题:核酸提取 氯仿 异丙醇的作用
核酸提取 氯仿 异丙醇的作用
酚氯仿法提取dna主要步骤:
1.将动物组织放在1.5ml的离心管中,分别用75%、50%酒精和纯水梯度脱酒精。每个梯度脱水时间为5-10min2.将组织放入研钵中,加入适量dna裂解液(300μl),研磨后再加入300μldna裂解液冲洗研磨棒。
3.将研磨好的组织液用移液枪加到1.5ml离心管,在管中加10μl蛋白酶k,用封口带将离心管封口,放入摇床(56℃,5h)。
4.加入等体积的tris饱和酚(500μl),摇匀(10min)。
5.离心。12000r,7min,4℃。离心后分成上中下三层,上层为dna,中层为蛋白质,下层为有机质。
6.吸取上层液体加入新的离心管。
7.配制tris饱和酚:氯仿:异戊醇=25:24:1。
8.在含有上清液的离心管中加入tris饱和酚、氯仿和异戊醇混合液450μl,摇匀10min。
9.离心。12000r,7min,4℃。
10.吸取上清液加到新的离心管,加入等体积的氯仿和异戊醇混合液400μl(氯仿:异戊醇=24:1)。
11.离心。12000r,7min,4℃。
12.吸取上清液加入新的离心管,加入2.5倍经过-20℃冷冻的100%的酒精。-20℃过夜。
13.将样品取出,12000r,7min,4℃离心。
14.弃上清,留白色沉淀(dna),加400μl的75%的经过-20℃冷冻的酒精,反复吹打溶解。
15.重复第14步骤2次(用75%酒精洗三次)。
16.提取dna完成。
溴氯仿法提取dna的原理:
用酚抽提细胞dna时,有什么作用。
使蛋白质变性,同时抑制了dnase的降解作用。用苯酚处理匀浆液时,由于蛋白与dna联结键已断,蛋白分子表面又含有很多极性基团与苯酚相似相溶。蛋白分子溶于酚相,而dna溶于水相。
使用酚的优点:
1.有效变性蛋白质;
2.抑制了dnase的降解作用。
缺点:
1.能溶解10-15%的水,从而溶解一部分poly(a)rna。
2.不能完全抑制rnase的活性。氯仿的作用。
氯仿。克服酚的缺点;加速有机相与液相分层。
最后用氯仿抽提。去除核酸溶液中的迹量酚。(酚易溶于氯仿中)
用酚-氯仿抽提细胞基因组dna时,通常要在酚-氯仿中加少许异戊醇,为什么。异戊醇:减少蛋白质变性操作过程中产生的气泡。异戊醇可以降低表面张力,从而减少气泡产生。另外,异戊醇有助于分相,使离心后的上层含dna的水相、中间的变性蛋白相及下层有机溶剂相维持稳定。
用乙醇沉淀dna时,为什么加入单价的阳离子。
用乙醇沉淀dna时,通常要在溶液中加入单价的阳离子,如nacl或naac,na+中和dna分子上的负电荷,减少dna分子之间的同性电荷相斥力,而易于聚集沉淀。
原理。动物和植物组织的脱氧核糖核蛋白(dnp)可溶于水或浓盐溶液(如1mol/l氯化钠),但在0.14mol/l氯化钠盐溶液中溶解度最低,而核酸核蛋白(rnp)则在0.14mol/l氯化钠中溶解度最大,利用这一性质可将其分开。
将沉淀物溶解于生理盐水,加入去污剂十二烷基硫酸钠(sds)溶液,使dna与蛋白质分离开。加入固体氯化钠使其浓度达到1mol/l,使dna溶解。加氯仿-异戊醇去除蛋白质,也可重复该步操作得较纯dna。最后用95%乙醇沉淀dna。
溶解。将离心后除去rna的沉淀,用30ml生理盐水溶解,充分搅拌后,匀浆一次。加4毫升10%sds溶液,使溶液的sds浓度达到1%左右,边加边搅拌,放置60℃水浴保温10分钟(不停搅拌),冷却。加固体氯化钠,使溶液氯化钠浓度达到1mol/l,充分搅拌10分钟;
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