耕地占用税缴纳之后不能免土地使用税

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恒远房地产公司2014年在a市通过招拍挂获取一宗1000亩土地，在办理土地使用权证时，a市国土局、税务局要求其按照每亩1.5万元缴纳耕地占用税，约计1500万元。该公司提出疑问，招拍挂建设用地属于“净地”，土地出让金都缴纳了，怎么还要缴纳耕地占用税呢。退一步说，缴纳了耕地占用税之后是否有说法可以一年之后才开始缴纳城镇土地使用税呢。

这个问题不止一家企业提问，税企可谓众说纷纭，难道这两个税种也要重复征税吗。

耕地占用税该谁缴纳。